Les marqueurs moléculaires constituent des outils appropriés pour l’évaluation de la diversité génétique des espèces cultivées. Ils sont importants pour la détection des gènes d’intérêts agronomiques et permettent d’accélérer le processus de sélection variétale. Ainsi, cette étude vise à identifier des marqueurs polymorphes mononucléotidiques (SNP) afin de mieux apprécier la diversité génétique du sorgho grains sucrés. A cet effet, la technique de génotypage par séquençage (GBS), utilisant la technologie DArT (Diversity Array Technologie) a été utilisée pour identifier les SNP du génome de sorgho grains sucrés. Les bibliothèques réduites ont été séquencées à l'aide du séquenceur Hiseq 2500 illumina. Les fréquences alléliques, les paramètres de diversité génétiques et le niveau de structuration du matériel végétal ont été déterminés. Les résultats du séquençage ont permis d’identifier 5811 marqueurs SNP, dont 55,4 % ont été des transitions et 44,6 % des transversions. Au total, 40 marqueurs SNP ont été plus polymorphes avec des fréquences de l’allèle majeur (FAM) inférieur à 90 % et une diversité de gêne (GD) supérieure à 0,30. Les génotypes ont été structurés en deux races principales et une race intermédiaire. Le dendrogramme construit a permis cependant, de classer les génotypes en quatre groupes dont deux groupes sont constitués en majorité des génotypes provenant de la zone sub-sahélienne et les deux autres sont un mélange de génotypes provenant des trois zones agro-climatiques. Cette étude a révélé la première carte de liaison SNP pouvant être utilisée pour identifier des QTLs pour un programme de sélection efficace grâce à la sélection assistée par marqueurs.

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