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Bacterial and archaeal communities in Lake Nyos (Cameroon, Central Africa),
Auteur(s): Rosine E. Tiodjio, Akihiro Sakatoku, Akihiro Nakamura, Daisuke Tanaka, Wilson Y. Fantong, Kamtchueng B. Tchakam, Gregory Tanyileke, Takeshi Ohba, Victor J. Hell, Minoru Kusakabe, Shogo Nakamura & Akira Ueda
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Résumé

L'étude a utilisé la technique de PCR-DGGE (électrophorèse sur gel de gradient dénaturant des produits de
réactions en chaîne de la polymérase), pour générer les profils génétiques des procaryotes dans des
échantillons de la colonne d’eau du lac Nyos. Par ailleurs, le clonage et le séquençage des gènes ARNr 16S
ont été effectués sur les échantillons des deux lacs. Cette première approche dans l'étude de la diversité
procaryotique du lac Nyos a permis la connaissance de la composition et de la diversité des communautés
procaryotes, ce qui renforce la compréhension du fonctionnement biogéochimique plausible du lac, et qui
peut être utilisé pour surveiller et prévoir les changements environnementaux et guider les études en
écologie microbienne. Une riche diversité microbienne susceptible d'inclure plusieurs nouveaux microorganismes a été révélée et les séquences d’ADN de procaryotes détectées déposées dans les banques de
données GenBank et du Japon.
L’analyse des échantillons d’eau du lac a révélé une communauté composée de potentiels phyla bactériens
que sont : Actinobactéries (28,3%), Firmicutes (19,6%), Protéobactéries (15,2%), Candidats divisions (TM7,
OP8, DO1) (10,9%), Bacteroidetes (8,7%), Chlorobi et Caldiserica (6,5 % chacune) et Fusobactéries et
Cyanobactéries (2,2 % chacune). L'embranchement Thaumacheota était le seul (100%) représentant potentiel des communautés archées. L’analyse des résultats a révélé des communautés bactériennes et archéennes
réparties en strates le long de la colonne d'eau indiquant une correspondance étroite des fonctions
microbiennes potentielles au modèle physico-chimique de la colonne d’eau du lac.

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