Identification de mycètes cultivables associés aux maladies de la tomate au Burkina Faso

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Résumé

Description du sujet. La culture de tomate est confrontée à une forte pression parasitaire limitant son rendement. Parmi les
agents pathogènes impliqués, de nombreux champignons sont décrits, mais peu ont été recensés jusqu’ici au Burkina Faso.
Objectifs. Identifier les agents pathogènes fongiques associés à la tomate en culture et/ou transmis par la graine.
Méthode. Les agents fongiques présents sur les échantillons de plantes malades ont été identifiés sur la base de caractéristiques
morphologiques et moléculaires après isolement sur milieu de culture. Ceux associés à la semence ont été identifiés après
incubation des graines en chambre humide et analyse de plantules après germination des graines.
Résultats. Trente-deux espèces fongiques ont été identifiées sur les échantillons de plantes malades et 11 à partir des semences,
avec des prévalences variables. Les principales espèces fongiques observées sur les plantes malades collectées en champs ont
été Fusarium oxysporum (Schltdl.) (66,4%), Colletotrichum sp. (27,4 %), Alternaria solani (Sorauer) (26,9 %), Alternaria sp.
(27,5 %), Botrytis cinerea (Pers) (24,1 %) et Fusarium equiseti (Sacc.) (19,5 %). La présence de F. oxysporum et Cercospora
kikuchii (Tak.) a été mise en évidence sur l’ensemble des 14 lots/variétés de graines analysées. Colletotrichum sp., Fusarium
solani (Mart.) Sacc. et B. cinerea ont été détectés sur la plupart des variétés testées. Epicoccum sp. (Sacc.) a été le saprophyte
le plus important aussi bien sur les semences (54,5 %) que sur les échantillons de plantes malades en culture (57,0 %).
Conclusions. La prévalence élevée de champignons pathogènes connus de la tomate sur les échantillons collectés en champs
et sur les lots de graines invite à approfondir la caractérisation des espèces et souches en présence, développer des mesures
de contrôle basées sur les connaissances épidémiologiques des espèces en présence, rechercher des moyens de contrôles
biologiques et assurer une meilleure qualité sanitaire des semences utilisées au Burkina Faso pour limiter les pertes encourues
en production.

Mots-clés

Champignon, semence, pathologie végétale, qualité des produits.